洁净实验室主要是利用洁净技术实现控制室内空气中尘埃、含菌浓度、温湿度、压力，以达到工作所需要的参数。洁净度是指每升空气中所含粒径≥0.5um的尘粒的总颗粒。

我国常规的洁净度标准划分为100级、1000级、10000级、100000级。

国际标准则划分为：1级、2级、3级、4级、5级。

洁净室一般实行两级隔离设施，第一隔离措施一般通过生物安全柜、负压柜、防护服、手套、眼罩等，第二隔离措施一般是通过实验室的建设防护、空调机组、以及电气控制等一系列措施。为了能达到净化等级，以及安全起见，空调机组风量一般按大的估算，尤其是高防护等级的洁净室，一般设计时要超过规范规定。

一般的洁净室大体上分为洁净区、非洁净区和一般区。然后每个区又细分为多种功能区。不同功能间的洁净度要求还可能不一样。一般来说洁净室还会有更衣区、洁净走廊等等。

洁净室实验室的主要配置：冷冻离心机、生物安全柜、冰箱、可移动紫外灯、全自动力核酸蛋白纯化仪、专用工作服和工作鞋等。